Организационной основой ФСМ являются ее первичные структуры - субъекты ФСМ.

На сегодняшний день в ФСМ работают 2 субъекта - "Молодые сторонники КПРФ" (МС КПРФ) и " Освобождение" (социалисты)

МС КПРФ объединяет юношей и девушек, которые поддерживают Коммунистическую партию Российской Федерации, субъект не только участвует в акциях ФСМ, но проводит собственные митинги, пикеты, лагеря и школы коммунистической молодежи.

Руководящим органом ФСМ является Правление . Председателем Правления на последней отчетно-выборной Конференции ФСМ был избран Василий Кривонос.